Protein–RNA interactions for Protein: Q12505

SKS1, Serine/threonine-protein kinase SKS1, yeastyeast

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SKS1Q12505 PET127YOR017W 2403 nt1.33□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 RPS27AYKL156W 249 nt1.33□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 RUF22RUF22 515 nt1.33□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 snR54snR54 86 nt1.33□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 MSN5YDR335W 3675 nt1.33□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 NUP188YML103C 4968 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 RVS161YCR009C 798 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 RTR1YER139C 681 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YLL020CYLL020C 306 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YSY6YBR162W-A 198 nt1.32□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 FYV8YGR196C 2454 nt1.31□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 MAD1YGL086W 2250 nt1.31□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 HIT1YJR055W 495 nt1.31□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 ZEO1YOL109W 342 nt1.31□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YPL182CYPL182C 384 nt1.31□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YPR063CYPR063C 423 nt1.31□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 SAS3YBL052C 2496 nt1.3□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 MSH3YCR092C 3057 nt1.3□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 CDC25YLR310C 4770 nt1.3□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YIL059CYIL059C 366 nt1.3□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 snR14snR14 160 nt1.3□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 snR41snR41 95 nt1.3□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 RAD9YDR217C 3930 nt1.29□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 SDH2YLL041C 801 nt1.29□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 NUT2YPR168W 474 nt1.29□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 FIG2YCR089W 4830 nt1.29□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 RFX1YLR176C 2436 nt1.29□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 MUK1YPL070W 1839 nt1.29□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YLL032CYLL032C 2478 nt1.28□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 CDC36YDL165W 576 nt1.28□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YBL071CYBL071C 309 nt1.28□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 TOM22YNL131W 459 nt1.28□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.28□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 SLY1YDR189W 2001 nt1.28□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 EFR3YMR212C 2349 nt1.28□□□□□ -2.2
SKS1Q12505 SPT21YMR179W 2277 nt1.27□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 YDR269CYDR269C 324 nt1.27□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 TIM13YGR181W 318 nt1.27□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.27□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.27□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 PIP2YOR363C 2991 nt1.26□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 MRPL31YKL138C 396 nt1.26□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 YLR287CYLR287C 1068 nt1.26□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 TRM732YMR259C 4263 nt1.26□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 SCW11YGL028C 1629 nt1.26□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 SWI4YER111C 3282 nt1.25□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.25□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 ATP19YOL077W-A 207 nt1.25□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 AIM44YPL158C 2277 nt1.25□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 PBY1YBR094W 2262 nt1.25□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 MPT5YGL178W 2580 nt1.25□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 NUT1YGL151W 3399 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 YLR101CYLR101C 396 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 GAL7YBR018C 1101 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 SEC3YER008C 4011 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 DIE2YGR227W 1578 nt1.24□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 SPC98YNL126W 2541 nt1.23□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.23□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 CYC7YEL039C 342 nt1.23□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 UPS1YLR193C 528 nt1.22□□□□□ -2.21
SKS1Q12505 MDS3YGL197W 4464 nt1.21□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 APL2YKL135C 2181 nt1.21□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 WIP1YDR374W-A 270 nt1.21□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YLR422WYLR422W 5799 nt1.2□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YDL011CYDL011C 324 nt1.2□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 RTT102YGR275W 474 nt1.2□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 ERP4YOR016C 624 nt1.2□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 ENV11YGR071C 2583 nt1.2□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 LAA1YJL207C 6045 nt1.2□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.19□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 APL3YBL037W 3078 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 EAF1YDR359C 2949 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 NUP145YGL092W 3954 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 FIG4YNL325C 2640 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 HCH1YNL281W 462 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 RPB10YOR210W 213 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 AHC1YOR023C 1701 nt1.18□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YGR130CYGR130C 2451 nt1.17□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 CBS1YDL069C 690 nt1.17□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YKL202WYKL202W 582 nt1.17□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 RPL33BYOR234C 324 nt1.17□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 NPC2YDL046W 522 nt1.16□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YBR012CYBR012C 420 nt1.16□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.16□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 ZIP2YGL249W 2115 nt1.16□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 STB6YKL072W 2301 nt1.16□□□□□ -2.22
SKS1Q12505 LCD1YDR499W 2244 nt1.15□□□□□ -2.23
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