Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 YOR015WYOR015W 360 nt2.07□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YOR302WYOR302W 78 nt2.07□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YOR333CYOR333C 417 nt2.07□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 NUP170YBL079W 4509 nt2.07□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 STB4YMR019W 2850 nt2.07□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 RTT107YHR154W 3213 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 CDC53YDL132W 2448 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YDR426CYDR426C 378 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 PFD1YJL179W 330 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YLR149CYLR149C 2193 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SEC16YPL085W 6588 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YGR250CYGR250C 2346 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SCW11YGL028C 1629 nt2.06□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 PEX8YGR077C 1770 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SPP41YDR464W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 KAP123YER110C 3342 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 snR55snR55 98 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 ISD11YER048W-A 285 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SNC1YAL030W 354 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 PCC1YKR095W-A 267 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YLR255CYLR255C 354 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SIR4YDR227W 4077 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 RGA1YOR127W 3024 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 UBP15YMR304W 3693 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 VPS8YAL002W 3825 nt2.05□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 COS111YBR203W 2775 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 CDC60YPL160W 3273 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SEF1YBL066C 3447 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YFR016CYFR016C 3702 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 BRP1YGL007W 378 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SCH9YHR205W 2475 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YJL182CYJL182C 318 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 CYB5YNL111C 363 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 VMA9YCL005W-A 222 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 VPS34YLR240W 2628 nt2.04□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 MNE1YOR350C 1992 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 KOG1YHR186C 4674 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 SSS1YDR086C 243 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 PAU2YEL049W 363 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YJL135WYJL135W 318 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 NOP14YDL148C 2433 nt2.03□□□□□ -2.08
UBX3Q12229 PEP3YLR148W 2757 nt2.03□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 PXA2YKL188C 2562 nt2.03□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YBR184WYBR184W 1572 nt2.02□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 SSQ1YLR369W 1974 nt2.02□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YGL052WYGL052W 306 nt2.02□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 INA22YIR024C 651 nt2.02□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.02□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YMR321CYMR321C 318 nt2.02□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 MMS22YLR320W 4365 nt2.02□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 CDC27YBL084C 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 STH1YIL126W 4080 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 GRR1YJR090C 3456 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 GPG1YGL121C 381 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YGR151CYGR151C 336 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 RPL42BYHR141C 321 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 RPL42AYNL162W 321 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 USO1YDL058W 5373 nt2.01□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 EFR3YMR212C 2349 nt2□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 TRX1YLR043C 312 nt2□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 CSE2YNR010W 450 nt2□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 HER1YOR227W 3741 nt2□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 CFT2YLR115W 2580 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 Q0092Q0092 141 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 EMP24YGL200C 612 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YNL028WYNL028W 318 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YBL083CYBL083C 426 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YOL160WYOL160W 342 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 HSL1YKL101W 4557 nt1.99□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 RIC1YLR039C 3171 nt1.98□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 CAT2YML042W 2013 nt1.98□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 INO80YGL150C 4470 nt1.98□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 BUD2YKL092C 3315 nt1.98□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 CRM1YGR218W 3255 nt1.98□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 PLC1YPL268W 2610 nt1.98□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 SMY1YKL079W 1971 nt1.98□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 VIK1YPL253C 1944 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 ATG9YDL149W 2994 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 LCD1YDR499W 2244 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 YNL114CYNL114C 372 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 TOR2YKL203C 7425 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 SET2YJL168C 2202 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.97□□□□□ -2.09
UBX3Q12229 PDR8YLR266C 2106 nt1.96□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 MPT5YGL178W 2580 nt1.96□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 snR72snR72 98 nt1.96□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YDR286CYDR286C 345 nt1.96□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 RPL37BYDR500C 267 nt1.96□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.96□□□□□ -2.1
UBX3Q12229 YBL012CYBL012C 402 nt1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms