Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.09□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YLR255CYLR255C 354 nt2.09□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.09□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 YOR333CYOR333C 417 nt2.09□□□□□ -2.07
PUF2Q12221 NPR2YEL062W 1848 nt2.09□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 STB4YMR019W 2850 nt2.09□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 BRE1YDL074C 2103 nt2.09□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 CDC53YDL132W 2448 nt2.09□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 VMR1YHL035C 4779 nt2.09□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 PEX8YGR077C 1770 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 GYP5YPL249C 2685 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 UBP1YDL122W 2430 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 MVP1YMR004W 1536 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 snR60snR60 104 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YJL182CYJL182C 318 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 CYB5YNL111C 363 nt2.08□□□□□ -2.08 RIP-Chip
PUF2Q12221 YBR224WYBR224W 516 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YGR250CYGR250C 2346 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 SEC31YDL195W 3822 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YPR097WYPR097W 3222 nt2.08□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 KAP123YER110C 3342 nt2.07□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 UPS1YLR193C 528 nt2.07□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 SEF1YBL066C 3447 nt2.07□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 GIP3YPL137C 3831 nt2.06□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 REV3YPL167C 4515 nt2.06□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 CDC27YBL084C 2277 nt2.06□□□□□ -2.08 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR426CYDR426C 378 nt2.06□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 TRX1YLR043C 312 nt2.06□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YLR149CYLR149C 2193 nt2.06□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 RIC1YLR039C 3171 nt2.06□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 CRM1YGR218W 3255 nt2.06□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 SPP41YDR464W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 Q0092Q0092 141 nt2.05□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 GPG1YGL121C 381 nt2.05□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.05□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.05□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 NOP53YPL146C 1368 nt2.05□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 PEP3YLR148W 2757 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YOR302WYOR302W 78 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YBR184WYBR184W 1572 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 IRR1YIL026C 3453 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 MGM1YOR211C 2646 nt2.04□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 EFR3YMR212C 2349 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 LCD1YDR499W 2244 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 SMY1YKL079W 1971 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 KOG1YHR186C 4674 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YDR286CYDR286C 345 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 PAU2YEL049W 363 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YGL052WYGL052W 306 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 PFD1YJL179W 330 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 YNL028WYNL028W 318 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 VPH1YOR270C 2523 nt2.03□□□□□ -2.08
PUF2Q12221 VPS34YLR240W 2628 nt2.03□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 PXA2YKL188C 2562 nt2.02□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.02□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YGR151CYGR151C 336 nt2.02□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 CSE2YNR010W 450 nt2.02□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 USO1YDL058W 5373 nt2.02□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 MET18YIL128W 3099 nt2.01□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.01□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YOL160WYOL160W 342 nt2.01□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YOR015WYOR015W 360 nt2.01□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 CFT2YLR115W 2580 nt2.01□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 IST2YBR086C 2841 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 PLC1YPL268W 2610 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YMR321CYMR321C 318 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YBL083CYBL083C 426 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 GRR1YJR090C 3456 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 SEC16YPL085W 6588 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 SCH9YHR205W 2475 nt2□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 MNE1YOR350C 1992 nt1.99□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 SET2YJL168C 2202 nt1.99□□□□□ -2.09 RIP-Chip
PUF2Q12221 RGA1YOR127W 3024 nt1.99□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 YNL114CYNL114C 372 nt1.99□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 RTT101YJL047C 2529 nt1.99□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 VIK1YPL253C 1944 nt1.99□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 TRL1YJL087C 2484 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 NEO1YIL048W 3456 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 ELG1YOR144C 2376 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 SSS1YDR086C 243 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 INA22YIR024C 651 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 CHC1YGL206C 4962 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 PEP1YBL017C 4740 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 MUK1YPL070W 1839 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 MNL2YLR057W 2550 nt1.98□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 SNF5YBR289W 2718 nt1.97□□□□□ -2.09 RIP-Chip
PUF2Q12221 INP2YMR163C 2118 nt1.97□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 RPH1YER169W 2391 nt1.97□□□□□ -2.09
PUF2Q12221 TOR2YKL203C 7425 nt1.96□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 VPS55YJR044C 423 nt1.96□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 TUS1YLR425W 3924 nt1.96□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 CDC60YPL160W 3273 nt1.95□□□□□ -2.1
PUF2Q12221 COS111YBR203W 2775 nt1.95□□□□□ -2.1
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