Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RBBP4Q09028 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RBBP4Q09028 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms