Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL1Q08397 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms