Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC3A1Q07837 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms