Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
KRTAP1-1Q07627 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KRTAP1-1Q07627 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms