Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 MBB1YJL199C 327 nt2.81□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 YLL066W-BYLL066W-B 171 nt2.81□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 COX14YML129C 213 nt2.81□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 TFC4YGR047C 3078 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 CDC53YDL132W 2448 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 FRE2YKL220C 2136 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 YOR102WYOR102W 351 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 RPB10YOR210W 213 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 ZRG8YER033C 3231 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 NFT1YKR103W 3657 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 COY1YKL179C 2040 nt2.8□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 YGR050CYGR050C 357 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 SLM1YIL105C 2061 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 AMS1YGL156W 3252 nt2.79□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 RFX1YLR176C 2436 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 IRR1YIL026C 3453 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 PFF1YBR074W 2931 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 CBF2YGR140W 2871 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 RPL23BYER117W 414 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 SMY2YBR172C 2223 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 SWI5YDR146C 2130 nt2.78□□□□□ -1.96
HDA2Q06629 snR45snR45 172 nt2.77□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 MGM1YOR211C 2646 nt2.77□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 SET2YJL168C 2202 nt2.77□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 SWR1YDR334W 4545 nt2.76□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 UBP14YBR058C 2346 nt2.76□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 CLN3YAL040C 1743 nt2.76□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 YKU80YMR106C 1890 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 PTP3YER075C 2787 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 MRD1YPR112C 2664 nt2.75□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 EMP24YGL200C 612 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 MPT5YGL178W 2580 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 UTP14YML093W 2700 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 VMR1YHL035C 4779 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 VTC3YPL019C 2508 nt2.74□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 CYR1YJL005W 6081 nt2.73□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 HEH2YDR458C 1992 nt2.73□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 YOR218CYOR218C 420 nt2.73□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 ECM29YHL030W 5607 nt2.72□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 NMD2YHR077C 3270 nt2.72□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 YNL018CYNL018C 1839 nt2.72□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 ATG13YPR185W 2217 nt2.72□□□□□ -1.97
HDA2Q06629 NUM1YDR150W 8247 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YCR043CYCR043C 384 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 PAA1YDR071C 576 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 BUB1YGR188C 3066 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 RGC1YPR115W 3252 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 LYS14YDR034C 2373 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 MCM10YIL150C 1716 nt2.71□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 HYP2YEL034W 474 nt2.7□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 MMS1YPR164W 4224 nt2.7□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 DBP10YDL031W 2988 nt2.7□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YPL216WYPL216W 3309 nt2.7□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 SEC7YDR170C 6030 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 snR62snR62 100 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.69□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 SMC6YLR383W 3345 nt2.68□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YIL169CYIL169C 2988 nt2.68□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.68□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YIL080WYIL080W 4722 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 NIP100YPL174C 2607 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YER138CYER138C 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YER160CYER160C 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YJR027WYJR027W 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YML039WYML039W 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YML045WYML045W 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YMR050CYMR050C 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 PAU8YAL068C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 PAU18YLL064C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YLR282CYLR282C 342 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YBL012CYBL012C 402 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 PAU6YNR076W 363 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 PAU20YOL161C 363 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 ELG1YOR144C 2376 nt2.67□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 MSB2YGR014W 3921 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 ATP7YKL016C 525 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YNL211CYNL211C 261 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 RAX2YLR084C 3663 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 ILS1YBL076C 3219 nt2.66□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 ZRG17YNR039C 1818 nt2.65□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 YME2YMR302C 2553 nt2.65□□□□□ -1.98
HDA2Q06629 SRP14YDL092W 441 nt2.65□□□□□ -1.99
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