Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.25□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 GMC2YLR445W 567 nt0.25□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 SPC2YML055W 537 nt0.25□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.25□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 QCR7YDR529C 384 nt0.24□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 UPS1YLR193C 528 nt0.24□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YPR170CYPR170C 336 nt0.24□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 ENV11YGR071C 2583 nt0.23□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 RRI2YOL117W 1938 nt0.23□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YGR042WYGR042W 816 nt0.23□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.23□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YPR099CYPR099C 357 nt0.23□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 CHS6YJL099W 2241 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 IPI3YNL182C 1668 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 PAN3YKL025C 2040 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YDR008CYDR008C 351 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 MET32YDR253C 576 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 INA22YIR024C 651 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YOR218CYOR218C 420 nt0.22□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 snR84snR84 550 nt0.21□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 POL32YJR043C 1053 nt0.21□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 COG4YPR105C 2586 nt0.21□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 LRP1YHR081W 555 nt0.2□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.2□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 RRT1YBL048W 312 nt0.2□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 SLI15YBR156C 2097 nt0.19□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YOR029WYOR029W 336 nt0.19□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YPL197CYPL197C 414 nt0.19□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.19□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 GEA2YEL022W 4380 nt0.19□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 RPS24BYIL069C 408 nt0.18□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.18□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YNL150WYNL150W 408 nt0.18□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YOR282WYOR282W 321 nt0.18□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YBR071WYBR071W 636 nt0.18□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 RSM23YGL129C 1353 nt0.18□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 NPR2YEL062W 1848 nt0.17□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 PMP1YCR024C-A 123 nt0.17□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.17□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 CUP1-1YHR053C 186 nt0.17□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 CUP1-2YHR055C 186 nt0.17□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 YKL111CYKL111C 336 nt0.17□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 SBH1YER087C-B 249 nt0.16□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 TIM10YHR005C-A 282 nt0.16□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 ULP2YIL031W 3105 nt0.16□□□□□ -2.38
PKR1Q03880 PPN1YDR452W 2025 nt0.15□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 RPL26BYGR034W 384 nt0.15□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 PAU12YGR294W 363 nt0.15□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 LIN1YHR156C 1023 nt0.15□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.15□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 TFB6YOR352W 1032 nt0.15□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 NOP9YJL010C 2001 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 BEM3YPL115C 3387 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 RSM27YGR215W 333 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 UBX4YMR067C 1251 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 MYO1YHR023W 5787 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YLL032CYLL032C 2478 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 UTP20YBL004W 7482 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YCK3YER123W 1575 nt0.14□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YDR220CYDR220C 294 nt0.13□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 RPL9AYGL147C 576 nt0.13□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 RPC10YHR143W-A 213 nt0.13□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 TAD1YGL243W 1203 nt0.12□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 RPL32YBL092W 393 nt0.12□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 TRS65YGR166W 1683 nt0.11□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YHL042WYHL042W 453 nt0.11□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 CMC1YKL137W 336 nt0.11□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.11□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 NPC2YDL046W 522 nt0.1□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 BUD26YDR241W 288 nt0.1□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 SPO11YHL022C 1197 nt0.1□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt0.1□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.1□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 LOA1YPR139C 903 nt0.1□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 BI4Q0120 1917 nt0.1□□□□□ -2.39
PKR1Q03880 MRPL31YKL138C 396 nt0.09□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.09□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YLR252WYLR252W 306 nt0.09□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 AI1Q0050 2505 nt0.09□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YJR003CYJR003C 1560 nt0.08□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 ESP1YGR098C 4893 nt0.07□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YLR217WYLR217W 324 nt0.07□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 RPL26AYLR344W 384 nt0.07□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 RPS30BYOR182C 192 nt0.07□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.06□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.06□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.06□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 BIR1YJR089W 2865 nt0.05□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 RFX1YLR176C 2436 nt0.05□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YFR057WYFR057W 456 nt0.05□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.05□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 UBC7YMR022W 498 nt0.05□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 CSM4YPL200W 471 nt0.05□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.05□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YNL054W-BYNL054W-B 5250 nt0.04□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YDR344CYDR344C 444 nt0.04□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 GPG1YGL121C 381 nt0.04□□□□□ -2.4
PKR1Q03880 YBL062WYBL062W 381 nt0.04□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25 ms