Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SLC25A11Q02978 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC25A11Q02978 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms