Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CDK17Q00537 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDK17Q00537 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms