Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNRPNP63162 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNRPNP63162 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms