Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ERVFRD-1P60508 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFRD-1P60508 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms