Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCD1P59942 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCD1P59942 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms