Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EEFSECP57772 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
EEFSECP57772 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms