Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CASP9P55211 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP9P55211 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CASP9P55211 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CASP9P55211 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CASP9P55211 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CASP9P55211 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms