Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB4P54760 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms