Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNA2D1P54289 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms