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Protein–RNA interactions for Protein: P53551
HHO1, Histone H1, yeast
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258 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
HHO1
P53551
GUP1
YGL084C
1683 nt
0.2
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YDR008C
YDR008C
351 nt
0.19
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
LOC1
YFR001W
615 nt
0.19
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YGR042W
YGR042W
816 nt
0.19
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
UPS1
YLR193C
528 nt
0.19
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
MET32
YDR253C
576 nt
0.18
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YOL106W
YOL106W
354 nt
0.18
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YOR218C
YOR218C
420 nt
0.18
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
FMP27
YLR454W
7887 nt
0.18
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
QCR7
YDR529C
384 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YEL018C-A
YEL018C-A
534 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
TDA2
YER071C
381 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YJR140W-A
YJR140W-A
150 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
APL2
YKL135C
2181 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
RRT1
YBL048W
312 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
COX7
YMR256C
183 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
BEM3
YPL115C
3387 nt
0.17
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YCK3
YER123W
1575 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
OST1
YJL002C
1431 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
PMP1
YCR024C-A
123 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YEL030C-A
YEL030C-A
315 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
PAU12
YGR294W
363 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
RPS24B
YIL069C
408 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
INA22
YIR024C
651 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YMR304C-A
YMR304C-A
351 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YOR282W
YOR282W
321 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YPR099C
YPR099C
357 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
YMR160W
YMR160W
2451 nt
0.16
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
SLI15
YBR156C
2097 nt
0.15
□□□□□ -2.38
HHO1
P53551
PAN3
YKL025C
2040 nt
0.15
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
YIL134C-A
YIL134C-A
204 nt
0.15
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
YOR072W-A
YOR072W-A
249 nt
0.15
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
PPN1
YDR452W
2025 nt
0.14
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
NOP9
YJL010C
2001 nt
0.14
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
YER158W-A
YER158W-A
216 nt
0.14
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
RPL26B
YGR034W
384 nt
0.14
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
snR84
snR84
550 nt
0.13
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
YHL042W
YHL042W
453 nt
0.13
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
TRS65
YGR166W
1683 nt
0.13
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
IQG1
YPL242C
4488 nt
0.12
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
SBH1
YER087C-B
249 nt
0.12
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
LOA1
YPR139C
903 nt
0.12
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
NPR2
YEL062W
1848 nt
0.12
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
MLP2
YIL149C
5040 nt
0.12
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
LRP1
YHR081W
555 nt
0.1
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
YPL197C
YPL197C
414 nt
0.1
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
YBR071W
YBR071W
636 nt
0.1
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
IPI3
YNL182C
1668 nt
0.1
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
RRI2
YOL117W
1938 nt
0.09
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
SEC8
YPR055W
3198 nt
0.09
□□□□□ -2.39
HHO1
P53551
RPL9A
YGL147C
576 nt
0.09
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
TIM10
YHR005C-A
282 nt
0.09
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YMR153C-A
YMR153C-A
336 nt
0.09
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YOL013W-A
YOL013W-A
192 nt
0.09
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YBR121C-A
YBR121C-A
159 nt
0.09
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
ULP2
YIL031W
3105 nt
0.09
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YLL032C
YLL032C
2478 nt
0.09
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
POL32
YJR043C
1053 nt
0.08
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
UBX4
YMR067C
1251 nt
0.08
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
RSM27
YGR215W
333 nt
0.07
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
SPO11
YHL022C
1197 nt
0.07
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
RPC10
YHR143W-A
213 nt
0.07
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YNL150W
YNL150W
408 nt
0.07
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YDR344C
YDR344C
444 nt
0.06
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
TAD1
YGL243W
1203 nt
0.06
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YKL111C
YKL111C
336 nt
0.06
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
RPL26A
YLR344W
384 nt
0.06
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
RPL32
YBL092W
393 nt
0.06
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
MYO1
YHR023W
5787 nt
0.06
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
NPC2
YDL046W
522 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
CUP1-1
YHR053C
186 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
CUP1-2
YHR055C
186 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YLR252W
YLR252W
306 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
UBC7
YMR022W
498 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YOR029W
YOR029W
336 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
CSM4
YPL200W
471 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YOR192C-B
YOR192C-B
5313 nt
0.05
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
AFR1
YDR085C
1863 nt
0.04
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
LIN1
YHR156C
1023 nt
0.04
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
MRPL31
YKL138C
396 nt
0.04
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YLR146W-A
YLR146W-A
189 nt
0.04
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YMR013C-A
YMR013C-A
150 nt
0.04
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
MLP1
YKR095W
5628 nt
0.04
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
COG4
YPR105C
2586 nt
0.03
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YJR003C
YJR003C
1560 nt
0.03
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YER138W-A
YER138W-A
105 nt
0.03
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
TFB6
YOR352W
1032 nt
0.03
□□□□□ -2.4
HHO1
P53551
YFR057W
YFR057W
456 nt
0.02
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
YGR290W
YGR290W
444 nt
0.02
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
PET111
YMR257C
2403 nt
0.02
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
YDR220C
YDR220C
294 nt
0.01
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
YER076W-A
YER076W-A
348 nt
0.01
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
YJL127W-A
YJL127W-A
117 nt
0.01
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
COX12
YLR038C
252 nt
0.01
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
CDC33
YOL139C
642 nt
0.01
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
YOR108C-A
YOR108C-A
210 nt
0.01
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
BUD26
YDR241W
288 nt
0
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
BI4
Q0120
1917 nt
0
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
GPG1
YGL121C
381 nt
0
□□□□□ -2.41
HHO1
P53551
YKL145W-A
YKL145W-A
93 nt
0
□□□□□ -2.41
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