Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP5P51878 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP5P51878 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP5P51878 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP5P51878 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP5P51878 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP5P51878 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP5P51878 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP5P51878 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CASP5P51878 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CASP5P51878 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms