Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BCAMP50895 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BCAMP50895 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCAMP50895 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCAMP50895 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCAMP50895 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCAMP50895 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAMP50895 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAMP50895 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCAMP50895 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms