Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RXRGP48443 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RXRGP48443 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RXRGP48443 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RXRGP48443 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RXRGP48443 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RXRGP48443 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms