Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ME1P48163 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ME1P48163 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ME1P48163 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ME1P48163 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ME1P48163 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ME1P48163 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms