Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PTGDSP41222 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms