Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 MUK1YPL070W 1839 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 BNI1YNL271C 5862 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 RTT107YHR154W 3213 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 YDL062WYDL062W 426 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 SEC31YDL195W 3822 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 YDR344CYDR344C 444 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 CYB5YNL111C 363 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 DBP6YNR038W 1890 nt2.26□□□□□ -2.05
VID28P40547 GYP5YPL249C 2685 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 CDC60YPL160W 3273 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 MRP10YDL045W-A 288 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 YFH1YDL120W 525 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 YDR426CYDR426C 378 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 RAV1YJR033C 4074 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 YPR097WYPR097W 3222 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 TFC8YPL007C 1767 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 SLY1YDR189W 2001 nt2.25□□□□□ -2.05
VID28P40547 GIP3YPL137C 3831 nt2.24□□□□□ -2.05
VID28P40547 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.24□□□□□ -2.05
VID28P40547 YDR341CYDR341C 1824 nt2.24□□□□□ -2.05
VID28P40547 RFX1YLR176C 2436 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 CFT2YLR115W 2580 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 YJL015CYJL015C 285 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 YBL012CYBL012C 402 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 OST1YJL002C 1431 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 RTT101YJL047C 2529 nt2.23□□□□□ -2.05
VID28P40547 TRX1YLR043C 312 nt2.22□□□□□ -2.05
VID28P40547 YHL042WYHL042W 453 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 YIL032CYIL032C 357 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 PAU18YLL064C 363 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 PAU6YNR076W 363 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 YPR063CYPR063C 423 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 SYH1YPL105C 2550 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 INP2YMR163C 2118 nt2.21□□□□□ -2.06
VID28P40547 LYS14YDR034C 2373 nt2.2□□□□□ -2.06
VID28P40547 PLC1YPL268W 2610 nt2.2□□□□□ -2.06
VID28P40547 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.2□□□□□ -2.06
VID28P40547 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.2□□□□□ -2.06
VID28P40547 NAM7YMR080C 2916 nt2.2□□□□□ -2.06
VID28P40547 ELG1YOR144C 2376 nt2.2□□□□□ -2.06
VID28P40547 PET309YLR067C 2898 nt2.2□□□□□ -2.06
VID28P40547 IST2YBR086C 2841 nt2.19□□□□□ -2.06
VID28P40547 RGA1YOR127W 3024 nt2.19□□□□□ -2.06
VID28P40547 YGR069WYGR069W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
VID28P40547 HCS1YKL017C 2052 nt2.19□□□□□ -2.06
VID28P40547 YDL211CYDL211C 1119 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 RPL37BYDR500C 267 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 ALG13YGL047W 609 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 RPB10YOR210W 213 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 COG8YML071C 1824 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 ZRG17YNR039C 1818 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 YGR250CYGR250C 2346 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 USO1YDL058W 5373 nt2.18□□□□□ -2.06
VID28P40547 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 YGR265WYGR265W 411 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 MCM22YJR135C 720 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 YCL046WYCL046W 324 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 KIP1YBL063W 3336 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 MVP1YMR004W 1536 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 ARP7YPR034W 1434 nt2.17□□□□□ -2.06
VID28P40547 DCP2YNL118C 2913 nt2.16□□□□□ -2.06
VID28P40547 SIR4YDR227W 4077 nt2.16□□□□□ -2.06
VID28P40547 NEO1YIL048W 3456 nt2.16□□□□□ -2.06
VID28P40547 YDL118WYDL118W 381 nt2.16□□□□□ -2.06
VID28P40547 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.16□□□□□ -2.06
VID28P40547 TOR2YKL203C 7425 nt2.15□□□□□ -2.06
VID28P40547 FAB1YFR019W 6837 nt2.15□□□□□ -2.06
VID28P40547 MAK10YEL053C 2202 nt2.15□□□□□ -2.07
VID28P40547 RAD61YDR014W 1944 nt2.15□□□□□ -2.07
VID28P40547 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.14□□□□□ -2.07
VID28P40547 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.14□□□□□ -2.07
VID28P40547 ZIP1YDR285W 2628 nt2.13□□□□□ -2.07
VID28P40547 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.13□□□□□ -2.07
VID28P40547 YLL032CYLL032C 2478 nt2.12□□□□□ -2.07
VID28P40547 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.12□□□□□ -2.07
VID28P40547 SCW11YGL028C 1629 nt2.12□□□□□ -2.07
VID28P40547 LCD1YDR499W 2244 nt2.11□□□□□ -2.07
VID28P40547 TDA9YML081W 3756 nt2.11□□□□□ -2.07
VID28P40547 snR60snR60 104 nt2.11□□□□□ -2.07
VID28P40547 CTR9YOL145C 3234 nt2.11□□□□□ -2.07
VID28P40547 CAT2YML042W 2013 nt2.1□□□□□ -2.07
VID28P40547 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.1□□□□□ -2.07
VID28P40547 YJL135WYJL135W 318 nt2.1□□□□□ -2.07
VID28P40547 CHC1YGL206C 4962 nt2.09□□□□□ -2.07
VID28P40547 snR72snR72 98 nt2.09□□□□□ -2.07
VID28P40547 SDH2YLL041C 801 nt2.09□□□□□ -2.07
VID28P40547 snR49snR49 165 nt2.09□□□□□ -2.07
VID28P40547 HER1YOR227W 3741 nt2.09□□□□□ -2.08
VID28P40547 MSH5YDL154W 2706 nt2.09□□□□□ -2.08
VID28P40547 AGC1YPR021C 2709 nt2.09□□□□□ -2.08
VID28P40547 MSC6YOR354C 2079 nt2.08□□□□□ -2.08
VID28P40547 IRE1YHR079C 3348 nt2.08□□□□□ -2.08
VID28P40547 SPG3YDR504C 384 nt2.08□□□□□ -2.08
VID28P40547 HMI1YOL095C 2121 nt2.08□□□□□ -2.08
VID28P40547 BUD2YKL092C 3315 nt2.07□□□□□ -2.08
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