Protein–RNA interactions for Protein: P40084

RTR1, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR1P40084 snR14snR14 160 nt0.91□□□□□ -2.26
RTR1P40084 YOP1YPR028W 543 nt0.91□□□□□ -2.26
RTR1P40084 MPT5YGL178W 2580 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YGR045CYGR045C 363 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 ECM9YKR004C 1134 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 CSM4YPL200W 471 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 IFH1YLR223C 3258 nt0.9□□□□□ -2.27
RTR1P40084 TOF2YKR010C 2316 nt0.89□□□□□ -2.27
RTR1P40084 AIM44YPL158C 2277 nt0.89□□□□□ -2.27
RTR1P40084 SPO13YHR014W 876 nt0.89□□□□□ -2.27
RTR1P40084 PIG1YLR273C 1947 nt0.89□□□□□ -2.27
RTR1P40084 SAS3YBL052C 2496 nt0.89□□□□□ -2.27
RTR1P40084 QCR7YDR529C 384 nt0.88□□□□□ -2.27
RTR1P40084 RPL16AYIL133C 600 nt0.88□□□□□ -2.27
RTR1P40084 IRC23YOR044W 474 nt0.88□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YPR099CYPR099C 357 nt0.88□□□□□ -2.27
RTR1P40084 PAN3YKL025C 2040 nt0.88□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.87□□□□□ -2.27
RTR1P40084 SLM6YBR266C 453 nt0.87□□□□□ -2.27
RTR1P40084 SCEIQ0160 708 nt0.86□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YBR071WYBR071W 636 nt0.86□□□□□ -2.27
RTR1P40084 NUT2YPR168W 474 nt0.86□□□□□ -2.27
RTR1P40084 LTE1YAL024C 4308 nt0.86□□□□□ -2.27
RTR1P40084 SRP14YDL092W 441 nt0.85□□□□□ -2.27
RTR1P40084 HNT1YDL125C 477 nt0.85□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YDR114CYDR114C 303 nt0.85□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YDR509WYDR509W 348 nt0.85□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.85□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YMR254CYMR254C 309 nt0.85□□□□□ -2.27
RTR1P40084 AIM9YER080W 1884 nt0.84□□□□□ -2.27
RTR1P40084 WIP1YDR374W-A 270 nt0.84□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.84□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YOR248WYOR248W 303 nt0.84□□□□□ -2.27
RTR1P40084 YBR063CYBR063C 1215 nt0.84□□□□□ -2.27
RTR1P40084 MKT1YNL085W 2493 nt0.84□□□□□ -2.28
RTR1P40084 RIM20YOR275C 1986 nt0.84□□□□□ -2.28
RTR1P40084 ULP2YIL031W 3105 nt0.84□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YDR008CYDR008C 351 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR1P40084 CYC7YEL039C 342 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YLR252WYLR252W 306 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.83□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YDL187CYDL187C 330 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 URM1YIL008W 300 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YLR198CYLR198C 360 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YOL029CYOL029C 606 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YBR032WYBR032W 303 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 SPO23YBR250W 1572 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 AFR1YDR085C 1863 nt0.82□□□□□ -2.28
RTR1P40084 SET3YKR029C 2256 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR1P40084 AFB1YLR040C 675 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YMR321CYMR321C 318 nt0.81□□□□□ -2.28
RTR1P40084 SCW11YGL028C 1629 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YAP3YHL009C 993 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YJR079WYJR079W 330 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR1P40084 GMC2YLR445W 567 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR1P40084 UBC7YMR022W 498 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.8□□□□□ -2.28
RTR1P40084 FMP27YLR454W 7887 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR1P40084 LYS14YDR034C 2373 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YDL206WYDL206W 2289 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR1P40084 RUF22RUF22 515 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR1P40084 YOR199WYOR199W 330 nt0.79□□□□□ -2.28
RTR1P40084 PPN1YDR452W 2025 nt0.78□□□□□ -2.28
RTR1P40084 DCP1YOL149W 696 nt0.78□□□□□ -2.28
RTR1P40084 PDE2YOR360C 1581 nt0.78□□□□□ -2.29
RTR1P40084 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.78□□□□□ -2.29
RTR1P40084 ALY2YJL084C 3141 nt0.78□□□□□ -2.29
RTR1P40084 SWI6YLR182W 2412 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR1P40084 BUD3YCL014W 4911 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR1P40084 YJR087WYJR087W 351 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR1P40084 SDH2YLL041C 801 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR1P40084 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.77□□□□□ -2.29
RTR1P40084 STO1YMR125W 2586 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR1P40084 MMS4YBR098W 2076 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR1P40084 snR84snR84 550 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR1P40084 NBL1YHR199C-A 222 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR1P40084 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR1P40084 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR1P40084 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.76□□□□□ -2.29
RTR1P40084 PXA2YKL188C 2562 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR1P40084 PAN2YGL094C 3348 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR1P40084 MXR1YER042W 555 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR1P40084 SLY1YDR189W 2001 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR1P40084 IQG1YPL242C 4488 nt0.74□□□□□ -2.29
RTR1P40084 SPO11YHL022C 1197 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR1P40084 UPS1YLR193C 528 nt0.73□□□□□ -2.29
RTR1P40084 GRX5YPL059W 453 nt0.73□□□□□ -2.29
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