Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IGHMBP2P38935 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGHMBP2P38935 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms