Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT9P35527 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT9P35527 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT9P35527 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRT9P35527 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRT9P35527 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms