Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLIP1P30622 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CLIP1P30622 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms