Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERCC5P28715 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms