Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SSFA2P28290 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SSFA2P28290 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms