Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMA3P25788 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms