Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PTPRDP23468 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PTPRDP23468 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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