Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCP20941 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCP20941 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCP20941 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCP20941 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCP20941 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms