Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAB5AP20339 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms