Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP2B1P20020 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms