Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
TNNI3P19429 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TNNI3P19429 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms