Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SPI1P17947 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPI1P17947 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SPI1P17947 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms