Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKCSHP14314 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms