Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA4P13612 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA4P13612 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms