Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACTN1P12814 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms