Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CKBP12277 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CKBP12277 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKBP12277 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKBP12277 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKBP12277 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKBP12277 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKBP12277 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKBP12277 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CKBP12277 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKBP12277 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKBP12277 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CKBP12277 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CKBP12277 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CKBP12277 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CKBP12277 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKBP12277 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKBP12277 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKBP12277 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CKBP12277 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CKBP12277 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms