Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ODC1P11926 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ODC1P11926 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ODC1P11926 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ODC1P11926 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ODC1P11926 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms