Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM200BP0CF97 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAM200BP0CF97 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms