Protein–RNA interactions for Protein: P09341

CXCL1, Growth-regulated alpha protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL1P09341 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL1P09341 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms