Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDN1P05305 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDN1P05305 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms