Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COL4A1P02462 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A1P02462 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms