Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
POLR1AO95602 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
POLR1AO95602 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms