Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM13AO94988 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM13AO94988 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms