Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ECM2O94769 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ECM2O94769 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ECM2O94769 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ECM2O94769 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ECM2O94769 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ECM2O94769 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms